Indeks dysbiozy to wskaźnik stosowany do oceny stopnia zaburzeń równowagi mikrobiomu jelitowego, wskazujący na obecność i nasilenie dysbiozy. Mierzy odchylenia w różnorodności i składzie mikroorganizmów w porównaniu z zdrową populacją referencyjną. Wyższy indeks sugeruje większą dysbiozę, która może być powiązana z problemami zdrowotnymi, takimi jak stany zapalne, zaburzenia trawienne czy schorzenia metaboliczne.